Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sft2d1Q5SSN7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Sft2d1Q5SSN7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sft2d1Q5SSN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sft2d1Q5SSN7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sft2d1Q5SSN7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sft2d1Q5SSN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d1Q5SSN7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d1Q5SSN7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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