Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms