Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata48Q5NC83 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Spata48Q5NC83 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms