Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm12253Q5NC48 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm12253Q5NC48 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm12253Q5NC48 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm12253Q5NC48 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm12253Q5NC48 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gm12253Q5NC48 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Gm12253Q5NC48 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm12253Q5NC48 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Gm12253Q5NC48 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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