Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Taf3Q5HZG4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms