Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp22Q5DU02 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms