Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam208bQ5DTT3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam208bQ5DTT3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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