Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2f8Q58FA4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms