Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms