Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem40Q4FJU9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem40Q4FJU9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms