Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Garnl3Q3V0G7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Garnl3Q3V0G7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms