Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed1Q3V009 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed1Q3V009 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms