Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
D130052B06RikQ3UW13 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms