Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prom2Q3UUY6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prom2Q3UUY6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prom2Q3UUY6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prom2Q3UUY6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prom2Q3UUY6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prom2Q3UUY6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms