Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-Eb2Q3UUV9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms