Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chpf2Q3UU43 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Chpf2Q3UU43 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms