Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
A530084C06RikQ3UTW2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms