Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhdc9Q3USL1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhdc9Q3USL1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms