Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gm28047Q3US59 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm28047Q3US59 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28047Q3US59 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms