Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
E130208F15RikQ3UPV3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
E130208F15RikQ3UPV3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms