Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cep63Q3UPP8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cep63Q3UPP8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms