Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrc1Q3UPH1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms