Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cog7Q3UM29 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms