Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

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Length 781 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Spg7Q3ULF4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spg7Q3ULF4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spg7Q3ULF4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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