Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E330014E10RikQ3UL33 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E330014E10RikQ3UL33 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms