Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam83fQ3UKU4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam83fQ3UKU4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms