Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zswim8Q3UHH1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zswim8Q3UHH1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms