Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trip13Q3UA06 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trip13Q3UA06 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms