Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf180Q3U827 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf180Q3U827 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf180Q3U827 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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