Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp4Q3U4B1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms