Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gse1Q3U3C9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gse1Q3U3C9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms