Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rnf149Q3U2C5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf149Q3U2C5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Rnf149Q3U2C5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rnf149Q3U2C5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rnf149Q3U2C5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf149Q3U2C5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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