Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ccdc136Q3TVA9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc136Q3TVA9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms