Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp39Q3TIX9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms