Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2f1Q3THK3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2f1Q3THK3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2f1Q3THK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2f1Q3THK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2f1Q3THK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2f1Q3THK3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2f1Q3THK3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2f1Q3THK3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2f1Q3THK3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2f1Q3THK3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2f1Q3THK3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2f1Q3THK3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2f1Q3THK3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2f1Q3THK3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms