Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd2bQ3T9M1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd2bQ3T9M1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd2bQ3T9M1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd2bQ3T9M1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms