Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccbe1Q3MI99 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms