Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Riiad1Q3KNY5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Riiad1Q3KNY5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms