Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-M3Q31093 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms