Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna5Q2MKA5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna5Q2MKA5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms