Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cpne9Q1RLL3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne9Q1RLL3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne9Q1RLL3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms