Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rpusd3Q14AI6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpusd3Q14AI6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rpusd3Q14AI6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rpusd3Q14AI6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rpusd3Q14AI6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rpusd3Q14AI6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rpusd3Q14AI6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpusd3Q14AI6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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