Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf3ip1Q149C2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf3ip1Q149C2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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