Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 TAF5YBR198C 2397 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 RRI2YOL117W 1938 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 SPI1YER150W 447 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 AAR2YBL074C 1068 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 YOR053WYOR053W 342 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 OSH2YDL019C 3852 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 PAM1YDR251W 2493 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 CYM1YDR430C 2970 nt4.47□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 YEH2YLR020C 1617 nt4.46□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 AIM21YIR003W 2040 nt4.46□□□□□ -1.69
MCD1Q12158 HAA1YPR008W 2085 nt4.46□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 IRC2YDR112W 309 nt4.46□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 AGE2YIL044C 897 nt4.46□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YNL089CYNL089C 477 nt4.46□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YBR285WYBR285W 435 nt4.46□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 GDH2YDL215C 3279 nt4.46□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 AKL1YBR059C 3327 nt4.46□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 EBS1YDR206W 2655 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 AHC2YCR082W 387 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 ARF2YDL137W 546 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 SNA2YDR525W-A 240 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 ERV1YGR029W 570 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YHL026CYHL026C 948 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YHR212CYHR212C 336 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YAR060CYAR060C 336 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YBL010CYBL010C 843 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YSY6YBR162W-A 198 nt4.45□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 GWT1YJL091C 1473 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 RPP1AYDL081C 321 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YER068C-AYER068C-A 432 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 SPR6YER115C 576 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YGL015CYGL015C 393 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 PET54YGR222W 882 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YOR105WYOR105W 327 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 TOG1YER184C 2385 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YJL132WYJL132W 2253 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 KAR9YPL269W 1935 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 SCY1YGL083W 2415 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 IRC3YDR332W 2070 nt4.44□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 REB1YBR049C 2433 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 BUD5YCR038C 1929 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 ARG82YDR173C 1068 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 MVB12YGR206W 306 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 COA3YJL062W-A 258 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YML099W-AYML099W-A 330 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 ARG80YMR042W 534 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YPT53YNL093W 663 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YOR199WYOR199W 330 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YPR197CYPR197C 564 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 RAD52YML032C 1416 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 NAT1YDL040C 2565 nt4.43□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 NHX1YDR456W 1902 nt4.42□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 SSF1YHR066W 1362 nt4.42□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 SSL1YLR005W 1386 nt4.42□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YEL075CYEL075C 369 nt4.42□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YGR017WYGR017W 894 nt4.42□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.42□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.42□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YJR111CYJR111C 852 nt4.42□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YPL185WYPL185W 396 nt4.42□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 YER158CYER158C 1722 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 CDC55YGL190C 1581 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 EGT2YNL327W 3126 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 COX4YGL187C 468 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 RPS20YHL015W 366 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 INN1YNL152W 1230 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 CIN5YOR028C 888 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 PPQ1YPL179W 1650 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 UTP15YMR093W 1542 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 TCO89YPL180W 2400 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 HOS3YPL116W 2094 nt4.41□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 FMP25YLR077W 1752 nt4.4□□□□□ -1.7
MCD1Q12158 snR7-SsnR7-S 179 nt4.4□□□□□ -1.71
MCD1Q12158 SPT2YER161C 1002 nt4.4□□□□□ -1.71
MCD1Q12158 RTT102YGR275W 474 nt4.4□□□□□ -1.71
MCD1Q12158 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.4□□□□□ -1.71
MCD1Q12158 GPP1YIL053W 753 nt4.4□□□□□ -1.71
MCD1Q12158 FLD1YLR404W 858 nt4.4□□□□□ -1.71
MCD1Q12158 RPL13BYMR142C 600 nt4.4□□□□□ -1.71
MCD1Q12158 MPD2YOL088C 834 nt4.4□□□□□ -1.71
MCD1Q12158 YOR392WYOR392W 444 nt4.4□□□□□ -1.71
MCD1Q12158 YBR062CYBR062C 543 nt4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.4 ms