Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ppp4r2Q0VGB7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms