Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rundc1Q0VDN7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rundc1Q0VDN7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms