Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cnnm1Q0GA42 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnnm1Q0GA42 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms