Protein–RNA interactions for Protein: Q08122

Tle3, Transducin-like enhancer protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle3Q08122 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tle3Q08122 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tle3Q08122 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tle3Q08122 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tle3Q08122 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms