Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F13bQ07968 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
F13bQ07968 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms