Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pou6f1Q07916 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pou6f1Q07916 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pou6f1Q07916 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pou6f1Q07916 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pou6f1Q07916 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pou6f1Q07916 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms